Évolution Théorique et Expérimentale

Animateur : Mircea T. SOFONEA

Problématique :

Évolution des traits d’histoire de vie des parasites et de leurs hôtes

Objectifs :

Nos approches expérimentales vont de la caractérisation des effets phénotypiques de mutations jusqu’aux approches mathématiques d’analyse de données et de modélisation. Les systèmes expérimentaux utilisés au sein de l’équipe sont des microsporidies infectant des moustiques et des virus de plantes. L’équipe effectue aussi des analyses de données cliniques et épidémiologiques provenant de maladies infectieuses humaines telles celles causées par les virus de l’immunodéficience humaine (VIH), de la dengue, de l’hépatite C (VHC) et les papillomavirus humains (HPV). Nous nous intéressons en particulier aux phylogénies provenant de données de séquence virales. Enfin, l’équipe développement des modèles conceptuels afin d’étudier la dynamique et l’évolution des parasites, en particulier de leur virulence. Ces modèles se fondent le plus souvent sur des systèmes dynamiques décrivant l’épidémiologie ou la dynamique intra-hôte des parasites.
https://covid-ete.ouvaton.org/index.html

Mots-clés

évolution, adaptation, virulence, infections multiples, virus, microbiote, modélisation, génomique, épidémiologie

Virostyle : Evolution et diversité des styles de vie des pathogènes

Animateur : Vincent PEDERGNANA

Problématiques :

Evolution, diversité et interactions intra et inter-spécifiques dans des modèles viraux et bactériens ; flux d’informations biologiques et infections

Objectifs :

Nous étudions les interactions intra- et inter-spécifiques et les changements dans la diversité bactérienne du microbiote vaginal avec l’objectif de traiter la vaginose bactérienne par le biais de la thérapie phagique. Nous analysons l’impact des interactions hôte parasite dans la diversité des présentations cliniques des infections virales, avec un focus sur le HCV, le virus de la Dengue, les HPVs et les PyVs. Finalement nous essayons de comprendre l’impact sur les infections des variations dans la fidélité durant le flux de l’information biologique.

Mots-clés

Dysbioses du microbiote vaginal, thérapie phagique, infections et cancers, infections virales, fidélité de la transmission de l’information biologique

Perturbations, évolution et virulence dans populations et communautés

Animateur : Ramsès DJIDJOU-DEMASSE

Problématiques :

Étude de l’impact des perturbations environnementales sur les interactions hôte-parasite, du niveau des organismes à celui des populations et communautés.

Objectifs :

Comprendre les risques de transmission des maladies en fonction des caractéristiques génétiques et phénotypiques des (micro ou macro-) parasites et de leurs vecteurs (mollusques , arthropodes) et des perturbations auxquelles les systèmes parasites-hôtes-environnement sont soumis. Nous combinons des approches empiriques, expérimentales et de modélisation. Nos résultats ont vocation à déboucher sur des préconisations pratiques en direction des agriculteurs, éleveurs et gestionnaires afin de les aider à mettre en place des pratiques à même de limiter les risques de transmission.
https://www.youtube.com/watch?v=oUHynn4fS-s

Mots-clés

Écologie évolutive, santé, virulence, résistance, tolérance, changements environnementaux, hétérogénéité spatiotemporelle, biologie des populations, épidémiologie, phylogéographie