La plate-forme EvoLaps (www.evolaps.org) permet la visualisation de scénarios de propagation spatio-temporelle des épidémies, obtenus par inférence phylogéographique continue. Les changements de localités (transitions), dans une lecture « Top-Down » de l’arbre phylogénétique (de la racine à ses feuilles), sont représentés sur un fond cartographique à l’aide de chemins entre eux. Un faisceau de chemins représente alors un scénario phylogéographique. Une lecture brute de ces transitions produit des scénarios parfois complexes, et EvoLaps aide à leurs analyses avec des processus interactifs de sélection, de surbrillance, d’animation, mais aussi avec la possibilité de discrétiser, de façon dynamique et itérative, les localités continues en clusters de régions, permettant d’établir des scénarios phylogéographiques plus ou moins détaillés selon des cadres spatio-temporels spécifiques. EvoLaps propose également des outils permettant de corroborer des variables tierces au scénario phylogéographique comme la superposition de cartes d’intensité, ou le calcul d’états de caractères ancestraux, à partir de variables discrètes. Si vous souhaitez utiliser EvoLaps, le voir évoluer avec l’intégration de nouvelles fonctionnalités (modélisation en épidémiologie, phylogénétique, phylodynamique), n’hésitez pas à contacter F. Chevenet à francois.chevenet@ird.fr